自远古以来，匿身于异世界“祸野”的怪物“污秽”频频现身，打破人世间的安宁。为了抵御这场绵延千年的灾厄，一群被称为“阴阳师”的战士挺身而出，以智慧与勇气守护着人类的存续。少年焰魔堂辘轳（花江夏树 配音）曾立志成为史上最强、能祓除所有污秽的阴阳师。然而，一场惨绝人寰的“雏月之悲剧”却无情粉碎了他的梦想，让他意识到灾难的不可逆转，自此心灰意冷，放弃了阴阳师的宿命，沦为平凡的度日少年。某日，一位来自京都的名门阴阳师少女化野红绪（潘惠美 配音）闯入了辘轳的生活。一心以铲除污秽为己任的她，起初对毫无干劲的辘轳嗤之以鼻，两人在误打误撞之下开启了水火不容的同居生活。然而，红绪那坚定的决心与不屈的信念，如同一束光照亮了辘轳心中的阴霾，逐渐感化了他，让他重新燃起了战斗的热血与希望。与此同时，阴阳师总会的占卜结果揭示了一个惊人的宿命——辘轳与红绪正是千百年来众阴阳师所期盼的“双星之阴阳师”。他们被赋予了结为夫妻、诞下能终结人魔之争的“神子”的重任。起初对这荒唐命运极为抗拒的两人，在联手与污秽及其他阴阳师的连番激战中，逐渐加深了彼此的羁绊，并开始携手对抗这注定的命运。随着战斗的深入，辘轳发现红绪的哥哥石镜悠斗（村濑步 配音），竟与当年令自己失去一切的“雏月之悲剧”有着千丝万缕的联系。这位曾是辘轳挚友的青年，正是将雏月寮同伴变为污秽的幕后黑手。实力深不可测、甚至不惜使用禁术“污秽堕落”的悠斗，成为了两人面前最强大的宿敌。在经历了一系列生死攸关的考验后，辘轳与红绪逐渐接受了自身的命运，为了保护人类与祓除污秽而不断成长为真正的最强阴阳师。最终，两人凭借着强大的实力与深厚的羁绊，与悠斗展开了终结一切的命运决战，誓要在这条充满战火与羁绊的道路上，夺回属于人类的和平世界。