《神探狄仁杰3》由《凉州案-黑衣社》与《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华 饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中 饰）允准回老家并州休养。他本想于回家途中绕道凉州，看望门生曾泰并向其辞别，想着诗酒相会、笑谈功过，回乡后专心务农、垂钓汾水以颐养天年。然而，正如护卫李元芳（张子健 饰）所言，这看似平静的归乡之途，实则蕴藏着更大的杀机与阴谋。此时正值武周年间，边事频仍，连年征战导致军中缺饷、军心不宁。狄公正带领李元芳等人蜿蜒行进在去往凉州的山道中，《黑衣社》的惊天阴谋已悄然拉开帷幕。而在《漕渠魅影》一案中，大运河长江通往淮水的邗沟水面波涛汹涌。狂风暴雨之中，江淮盐铁转运使的运盐官船在此覆没——这已是短短一年内的第十五次惨剧，数百运卒丧生，数百万石食盐没于水中。朝廷派去查察的官员均无功而返，出漕调查的水部郎中李翰竟离奇自缢于任上。由于盐运受阻，扬州西北各地已爆发严重盐荒。武则天急召狄仁杰进宫，委任其为江南道黜置大使兼江淮都转运使，彻查邗沟覆船大案。狄公遂带领李元芳、曾泰火速赶赴扬州。本部历史侦探悬疑系列电视剧《神探狄仁杰》部部悬念迭出、情节扣人心弦。该系列不仅将扑朔迷离的悬疑剧情与恐怖的视觉元素融为一体，更加入了李元芳与狄如燕的爱情、狄仁杰与曾泰的师生之情，以及武则天与狄仁杰的君臣际遇等情感戏码，使得本剧在惊险刺激的段段奇案中，增添了不少动人心弦的温情色彩。