《青天衙门Ⅱ》由《将军之爱》、《望子成龙》、《审妻记》、《花轿奇谋》四个单元篇章组成。在一个旱雷闷响的夜晚，顺天府衙门外传来阵阵凄厉的喊冤声。一名泪流满面、泣不成声的书童手持鼓棒，拼命击鼓鸣冤。时任顺天府尹的谭振英闻讯，立刻率领衙役出门查看，并连夜升堂审问缘由。书童方庆被带上公堂，悲愤交加地哭诉了少爷方之栋与女子余清莲的凄惨遭遇。两人本是一对青梅竹马的恋人，无奈造化弄人，清莲被迫流落风尘，沦为卖艺女子。为了给清莲赎身，方之栋在街头日夜变卖字画攒钱。皇天不负有心人，之栋不仅将金钗赠予清莲作为定情信物，更将辛苦积攒下的五百两银子交至暖香居嬷嬷手中，终为清莲赎回了自由身。本以为有情人终成眷属，孰料天不遂人愿。就在之栋与清莲的新婚大喜之日，对清莲早已垂涎已久的富察家后人富察家康竟带人蛮横闯入，大肆捣毁礼堂。家康不仅将上前理论的书童方庆打昏，更痛殴了上前阻拦斥责的方之栋，随后强行奸辱了余清莲，扬长而去。清莲遭此奇耻大辱，自感玷污了方家门风，含怨割腕自尽。之栋眼见清莲血染满地，悲痛欲绝，亦决然追随爱人而去。方家二老悲痛欲绝，欲状告富察家康，然当地县令畏惧得罪九门提督，不但拒不受理，反而屈打方家二老。二老深感控诉无门，为防止顺天府尹与县令官官相护、包庇富察家康，两人最终决意以死相谏，用性命来鸣诉这沉冤血案……